El PMIZMC tiene como objetivo: - Contribuir a mejorar el acceso y los usos de los recursos que contienen las Zonas Marinos Costeras. - Fortalecer la gestión  sostenible de los recursos hidrobiológicos para garantizar la recuperación y conservación de la biomasa marina. - Conservar y restaurar la biodiversidad y los ecosistemas marino costeros para mantener su funcionalidad ecológica y los servicios que proveen. - Mejorar las condiciones sanitarias y ambientales de la ZMC mediante una gestión integral de residuos sólidos y efluentes domésticos. - Fortalecer las capacidades institucionales y técnicas para una gestión integrada, participativa y eficiente de la zona marino costera - Promover la educación ambiental y la participación ciudadana para fortalecer la corresponsabilidad en el manejo sostenible de la ZMC. - Orientar el uso y ocupación sostenible de las ZMC.