La Zonificación Económica y Ecológica ZEE es un instrumento técnico que permite conocer las potencialidades y limitaciones de un territorio y sus recursos naturales. El estudio permite identificar el abanico de posibilidades de uso sostenible que tiene el territorio de la Región Puno, desarrollado a nivel de meso zonificación (Escala 1000 000), los resultados del proceso de evaluación e integración temática, permitieron crear 11 sub modelos cartográficos los que sirvieron de insumo para la elaboración de la propuesta de ZEE, resultando 108 Unidades Ecológicas y Económicas  que se agruparon en cinco grandes zonas.