En el año 2001 fue elaborada una propuesta preliminar de Zonificación ecológica y económica del departamente de Madre de Dios. Dicha propuesta quedó como un documento de trabajo. Sin embargo ha servido para que algunas instituciones lo utilicen en forma aislada y no como parte de un proyecto regional orientado al desarrollo sostenible de Madre de Dios.La información generada en este proceso de ZEE, que está relacionada con la identificación de las potencialidades y limitaciones del territorio y de los recursos naturales, tiene como propósito facilitar la formulación de políticas, planes y programas orientados al ordenamiento territorial de cara al desarrollo sostenible del departamente de Madre de Dios. La propuesta fue elaborada a nivel de macrozonificación, utilizando una escala de trabajo de 1:250,000 y una escala de publicación de 1:700,000.