El Vice Ministro de Pesquería es autoridad inmediata al Ministro de la Producción en el Sub Sector de su competencia; formula, ejecuta y dirige por encargo de éste las políticas del sub-sector, las mismas que comprenden las actividades de extracción, transformación y cultivo pesquero de recursos hidrobiológicos marinos y de aguas continentales, velando por la explotación racional de los recursos naturales y la preservación del medio ambiente. Orienta y supervisa las actividades de los Organismos Públicos Descentralizados del sub-sector; asimismo supervisa las de los órganos competentes en los gobiernos regionales, de acuerdo con la política del sector y las directivas impartidas por el Ministro. La pesca afecta a los ecosistemas marinos porque disminuye la población de las especies, y estas capturas pueden influir en las relaciones ecológicas de los ecosistemas, sobre todo a nivel trófico.