El presente Plan Maestro, para los años 2000 – 2005, es el segundo que se elabora para esta Área Natural Protegida. Además de recoger diversos conceptos y programas planteados en su antecesor, aprobado en 1985, incorpora por un lado, los lineamientos de administración de áreas naturales protegidas del Perú desarrollados en los últimos quince años, y por otro lado, las experiencias de gestión del área, producto de la aplicación del proyecto “Ecodesarrollo del Santuario Nacional Lagunas de Mejía e Irrigación Iberia”, ejecutado por PRODENA – Arequipa.El Plan Maestro se elaboró mediante un proceso participativo en el que intervinieron las instituciones públicas y privadas, así como pobladores locales del área protegida y sus zonas de influencia; a través de entrevistas y un taller realizado en la sede de la Municipalidad de Mejía.