El Plan Maestro es el documento de planificación estratégica de más alto nivel para la gestión de un área natural protegida. Su elaboración es liderada por el Jefe del área natural protegida correspondiente y es realizada en forma concertada con el Comité de Gestión y con la colaboración de los gobiernos regionales y locales, los pobladores y las instituciones públicas y privadas vinculadas al área natural protegida.Después de 18 años se presenta el segundo Plan Maestro del Parque Nacional Yanachaga Chemillén, el cual acopió los métodos, procedimientos y técnicas de manejo de la biodiversidad, adecuándola a la Ley de Áreas Naturales Protegidas y su Reglamento; orientando así el proceso de desarrollo sostenible de la zona de amortiguamiento.