: Comparative metagenomics of bathypelagic plankton and bottom sediment from the Sea of Marmara

Presenta el an?lisis de metagen?mica comparativas de la alta mar, produce data metagen?mica por dirigir 454 pirosecuenciaci?n de batipel?gica plancton (1000 m de profundidad) y el sedimento del fondo del Mar de M?rmara, la puerta de enlace entre el Mediterr?neo Oriental y el Mar Negro. Los datos de peque?a subunidad ribosomal RNA (SSU rRNA) bibliotecas de genes y pirosecuenciaci?n directa de la misma
muestras indicaron que Gamma y Alfa-proteobacterias, seguido de Bacteroidetes, domin? el fracci?n bacteriana en Marmara en aguas profundas plancton, mientras que Planctomycetes, Delta y Gammaproteobacteria
fueron los grupos m?s abundantes en alta sedimento bacteriano-diversidad. Grupo I
Crenarchaeota / Thaumarchaeota domin? la fracci?n archaeal plancton, aunque el grupo II y III Euryarchaeota tambi?n estuvieron presentes. Los eucariotas son muy diversos en las bibliotecas de genes SSU rRNA, con
alveolates grupo I (Duboscquellida) y II (Syndiniales) y Radiozoa dominan el plancton y Opisthokonta y alveolates, los sedimentos. Sin embargo, las secuencias eucariotas eran escasos en pyrosequence datos. Arqueales genes amo eran abundantes en el plancton, lo que sugiere que Marmara planct?nicas
Thaumarchaeota son oxidantes del amon?aco. Los genes implicados en la reducci?n del sulfato, mon?xido de carbono oxidaci?n, anammox y sulfatasas estaban excesivamente representadas en los sedimentos. Contrataci?n del Genoma Los an?lisis mostraron que Alteromonas macleodii 'ecotipo superficie', ubique Pelagibacter y
Nitrosopumilus maritimus estaban altamente representados en 1.000 m de profundidad plancton. Un an?lisis comparativo
metagenomes de M?rmara con ALOHA aguas profundas y superficiales plancton, cad?veres de ballenas, Per?
sedimentos del subsuelo y suelo metagenomes agrupados en alta mar de M?rmara plancton con profundas ALOHA plancton y cad?veres de ballenas, probablemente debido a las condiciones sub?xicas en la profunda Marmara
columna de agua. El sedimento Marmara agrupado con el metagenoma suelo, destacando la com?n papel ecol?gico de ambos tipos de comunidades microbianas en la degradaci?n de la materia org?nica y el conclusi?n de los ciclos biogeoqu?micos.
Sin embargo, a pesar de que son clave para la biogeoqu?mica
ciclismo en nuestro planeta, la composici?n de los ecosistemas marinos
comunidades microbianas, su potencial metab?lico
y actividades y sus interacciones con el
medio ambiente siguen siendo poco conocidos. Un considerable
ha dedicado un esfuerzo aunque en los ?ltimos a?os para
estudio planct?nicas
.

Representación Territorial: 
Perú
Fecha de creación de documento: 
Enero, 2013

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